Badania archeologiczne pokazują, że warunki do rozwoju próchnicy istniały praktycznie od zawsze, jeszcze na długo przed pojawieniem się człowieka. Próchnicę znaleziono również na zębach dinozaurów, a zatem w epoce kredy. Pierwsze znaleziska potwierdzające występowanie tego schorzenia u człowieka pochodzą sprzed ok. 2 mln lat.